Splicing
Z Wikipedii
Splicing, składanie genu, wycinanie intronów - usunięcie intronów (sekwencji niekodujących) i połączenie egzonów (sekwencji kodujących) z prekursorowego mRNA organizmów eukariotycznych. Proces ten zachodzi podczas obróbki posttranskrypcyjnej po to, by dojrzały mRNA, przygotowany do translacji, kodował ciągły łańcuch polipeptydowy (od kodonu start do stop). Splicing katalizowany jest przez kompleks białek i RNA zwany spliceosomem. W niektórych przypadkach następuje samowycinanie się intronów, bez udziału spliceosomu, funkcję katalityczną pełni wówczas RNA (rybozym).
Spis treści |
[edytuj] Mechanizm splicingu
[edytuj] Wycinanie intronów przez spliceosom
Intron, by podlegał poprawnemu wycięciu, musi posiadać sygnały: sekwencję GU na końcu 5' i sekwencję AG na końcu 3' (dla spliceosomu klasycznego, odpowiedzialnego za przeważającą większość reakcji wycinania intronów, natomiast dla spliceosomu alternatywnego odpowiednio AU i AC) oraz tzw. miejsce rozgałęzienia, w którym znajduje się nukleotyd adeninowy (A). Podczas reakcji splicingu sekwencje sygnałowe są rozpoznawane przez wchodzące w skład spliceosomu małe jądrowe RNA (snRNA), które tworzą komplementarne połączenia RNA-RNA z obszarami terminalnymi i miejscem rozgałęzienia intronu. Splicing dokonywany przez spliceosom oraz samowycinanie zaczynają się od ataku grupy 2'OH nukleotydu adeninowego z miejsca rozgałęzienia na pierwszy nukleotyd intronu (koniec 5'), co powoduje powstanie pętli. Następnie grupa 3'-OH uwolnionego egzonu atakuje ostatni nukleotyd intronu na końcu 3', dzięki czemu egzony się łączą i uwalniany jest intron w formie lassa[1].
[edytuj] SamowycinajÄ…ce siÄ™ introny
Samowycinanie intronów odbywa się bez udziału spliceosomu, kiedy sam intron pełni funkcję rybozymu. Istnieje kilka grup samowycinających się intronów. Reakcja autokatalitycznego splicingu z udziałem intronów grupy I rozpoczyna się od ataku guanozyny (pochodzącej z intronu lub z wolnego kofaktora) na miejsce splicingowe 5'. Dla intronów grupy II pierwszym etapem reakcji jest atak grupy 2'hydroksylowej adenozyny pochodzącej z intronu na miejsce splicingowe 5'. Następnie grupa 3'OH egzonu na końcu 5' atakuje miejsce splicingowe na końcu 3', i egzony się łączą[2]. In vivo do zajścia reakcji samowycinania się wielu intronów potrzebne są dodatkowe białka, np. kodowane przez introny maturazy. Niektóre introny grupy II mogą funkcjonować jak transpozony, integrując do pozbawionych intronów alleli swojego genu[3].
[edytuj] Splicing alternatywny
Splicing alternatywny to łączenie ze sobą różnych egzonów, niekoniecznie po kolei (według genu), albo z pominięciem niektórych, a niektóre introny nie są usuwane. W ten sposób z jednego genu może powstać więcej niż jedna cząsteczka mRNA, co jest źródłem zmienności białek. Rekord należy do genu Dscam Drosophila melanogaster, który ma 38 000 wariantów splicingowych[4]. Ocenia się, że od 35 do 75% ludzkich genów podlega alternatywnemu splicingowi[5].
[edytuj] Choroby zwiÄ…zane z zaburzeniami splicingu
Zaburzenia splicingu mogą być przyczyną chorób. W dystrofii miotonicznej zmutowany RNA gromadzi się w komórkach, zaburzając splicing innych mRNA, co powoduje objawy choroby[6]. Podobnie niektóre postacie retinopatii barwnikowej związane są z zaburzeniami splicingu[7].
[edytuj] Linki zewnętrzne
- Animacja - mRNA splicing (w języku angielskim) źródło: Alberts, et al., Essential Cell Biology
Przypisy
- ↑ Alberts B, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P. Molecular Biology of the Cell. Fourth Edition. Garland Science 2002 ISBN 0-8153-4072-9
- ↑ Cech TR (2002) Ribozymes, the first 20 years. Biochem Soc Trans. 30 (Pt6):1162-6 PMID: 12440996
- ↑ Lehmann K, Schmidt U. (2003) Group II introns: structure and catalytic versatility of large natural ribozymes. Crit Rev Biochem Mol Biol. 38(3):249-303. PMID: 12870716
- ↑ Schmucker D, Clemens JC, Shu H, Worby CA, Xiao J, Muda M, Dixon JE, Zipursky SL. (2000) Drosophila Dscam is an axon guidance receptor exhibiting extraordinary molecular diversity. Cell 101(6):671-84. PMID: 10892653
- ↑ Mironov AA, Fickett JW, Gelfand MS. (1999) Frequent alternative splicing of human genes. Genome Res. 9(12):1288-93 PMID: 10613851
- ↑ Cho DH, Tapscott SJ. (2007) Myotonic dystrophy: emerging mechanisms for DM1 and DM2. Biochim Biophys Acta. 1772(2):195-204 PMID: 16876389
- ↑ Mordes D, Luo X, Kar A, Kuo D, Xu L, Fushimi K, Yu G, Sternberg P Jr, Wu JY. (2006) Pre-mRNA splicing and retinitis pigmentosa. Mol Vis. 12:1259-71. PMID: 17110909
Warning: curl_setopt() [function.curl-setopt]: CURLOPT_FOLLOWLOCATION cannot be activated when in safe_mode or an open_basedir is set in /www/motocykle_www/spam/adwiki/richFeeds.php on line 59
| Bundesbank Against Using Gold Reserves For Euro Monetary Fund |
|
Germany's Deutsche Bundesbank opposes using its gold reserves to back a possible European monetary fund, the central bank said Sunday, addressing a press report that said the German government is considering the option that euro-zone members use their reserves for such a purpose.
|
| CNOOC to buy into SAmerica's Bridas for $3.1 bln |
|
China National Offshore Oil Corp plans a joint venture with Argentina's Bridas Energy Holdings, paying $3.1 billion to take a 50 percent stake in Bridas Corporation, the company said on Sunday.
|
| Crew strike threatens BA's future |
|
British Transport Secretary Andrew Adonis urged cabin crew at British Airways on to call off their planned strikes this month, saying it threatened the company's very existence.
|
| 20 lat temu inflacja w Polsce osięgnęła rekordowy poziom 1395 proc. |
|
20 lat temu inflacja w Polsce osięgnęła rekordowy poziom 1395 proc. Udało się ją ograniczyć m.in. dzięki rygorystycznemu stosowaniu tzw. popiwku. Najwyższa w historii inflacja miała miejsce w lipcu 1944 r. na Węgrzech, gdzie co 15,6 godziny ceny rosły o 100 proc.
|
| W tym roku celnicy skonfiskowali ponad 360 jednorękich bandytów |
|
W ramach prowadzonych tzw. doraźnych kontroli punktów gier, od początku roku celnicy skonfiskowali ponad 360 automatów o niskich wygranych, tzw. jednorękich bandytów - wynika z sondy przeprowadzonej przez PAP w izbach celnych.
|